por ahi tenes poca RAM para ejecutarlo, ya que mugen consume recursos de mas...
O bien, puede ser un virus... o bien puede ser que justo en el sector del disco rigido donde copiaste ese juego esta medio dañado o trabado... o puede ser que el antivirus lo intenta escanear y al ser muy pesado se traba, o puede ser lo que siempre digo "tu compu esta loca"...
Usa la imaginacion, bajate otro mugen, proba sin AV, proba cambiarlo de lugar... fijate... xD